1. Brainnetome Atlas Viewer (V1.0) 

Brainnetome Atlas Viewer 是基于matlab平台开发的软件，其主要功能是查询及展示脑网络组图谱。 首先，该软件可以以二维和三维的方式呈现脑区亚区的最大概率图、概率图以及解剖与功能连接模式；其次，用户可以使用该软件提取感兴趣脑区及其亚区，用于后续分析。目前该软件已经推出v1.0版本，可公开免费下载。详细情况可关注脑网络组图谱网站（http://atlas.brainnetome.org/）。

图1. Brainnetome Atlas Viewer 

2. Brainnetome fMRI toolkit (BRAT) 

Brainnetome fMRI toolkit 是基于matlab平台和SPM库开发的工具包，其主要功能是利用神经影像数据计算和重构脑网络，从而刻画脑网络构架的属性。它具有自己独立的GUI，包括预处理、功能连接计算、网络属性计算、网络化视图、统计分析等多个功能。Brat适用于fMRI影像数据。目前该工具包已经推出v3.0版本，可公开免费下载（http://brant.brainnetome.org）。

图2. BRANT 3.36

3. DiffusionKit, 一站式的diffusion MRI数据分析小型工具包 

该工具包基于C/C++写成，调用了部分VTK, OpenCV, CImg库函数功能。具有体积小、功能全、运行快等特点。具体的能报包括DWI数据矫正、预处理、建模分析(DTI和HARDI，支持single-shell和multi-shell数据，如美国HCP的数据)、纤维跟踪统计、网络构建，以及各种数据的可视化，包括3D, 4D, ODF, fiber track等数据的可视化。具体信息请访问网站 http://diffusion.brainnetome.org/ 。

4. DTI Tracking System 

DTI Tracking System是一款针对扩散MRI影像数据的分析软件，它包括DTI数据的一些常规处理，例如张量模型重构，张量解算，确定性纤维跟踪及概率性纤维跟踪。该软件可以在windows XP/VISTA/7/8操作系统中使用，目前已推出v1.0版本，可以免费下载。

图3. DTI Tracking System